تأسست شعبة ضمان الجودة والأداء الجامعي في مركز علوم البحار عام 2009، مرتبطة من حيث الهيكل التنظيمي بمكتب المدير العام  وكانت سابقاً عبارة عن لجنة تسمى بلجنة الأداء الجامعي.