أنشئ قسم الرسوبيات والقيعان البحرية في منتصف عام 1979 وذلك للحاجة الضرورية لقسم متخصص بأجراء المسوحات والدراسات الجيولوجية وكان لهذا القسم دورا كبيرا في دراسة ترسبات السهل الرسوبي متضمنة دراسة الجوانب الترسيبية والمعدنية وخواص الرسوبيات والقيعان البحرية وتكويناتها الكيميائية والفيزيائية وخواصها البيئية وعلاقتها بالمياه العذبة والبحرية.